Дмитрий Ганенко родился в 1988 году. В 2006 году окончил Среднюю специальную музыкальную школу при Санкт-Петербургской государственной консерватории. В 2006–2011 годах обучался в Санкт-Петербургской консерватории в классе А. П. Никитина, в 2010–2012 годах – в Высшей школе музыки им. Х. Эйслера в Берлине под руководством Трольса Сване.
Принимал участие во многих международных фестивалях (в том числе в фестивале «Новые имена»). Лауреат Международного конкурса Центральной музыкальной школы в Москве (I премия, 2006), Международного конкурса в Жерарме (I премия, 2007), Международного конкурса Фонда Гартов в Санкт-Петербурге (I премия, 2007) и Международного конкурса им. Е. Мравинского в Санкт-Петербурге (I премия, 2008).
